Συνοπτικά διακρίνονται 5 μεγάλες χρονικές ενότητες στο διοικητικό καθεστώς του Αιγαίου:
1. Ύστερη Αρχαιότητα – Πρώιμη βυζαντινή περίοδος: Ο νησιωτικός χώρος υπάγεται διοικητικά στις μεγάλες επαρχίας της Αχαΐας και των Νήσων.
2. Αρχή του 8ου αι. -μέσα του 9ου: Άμεσα αρμόδιοι για τη διοίκηση είναι οι άρχοντες και δρουγγάριοι του ναυτικού.
3. Μέσα του 9ου αι. - τέλη του 10ου: Τα νησιά περιλαμβάνονται στο σύστημα των θεμάτων.
4. Τέλη του 10ου - τέλη του 11ου: Εμφανίζονται νέα νησιωτικά θέματα και εδραιώνεται η πολιτική διοίκηση.
5. Τέλη του 11ου έως τα τέλη του 12ου: Διοικητικός κατακερματισμός. Προωθείται η διοίκηση σε τοπικό επίπεδο με τους δούκες των νησιών.